O romance tem três histórias: 1º - a narrativa, conduzida em nome do anjo Agasfera, cujo nome significa "Amado de Deus"; 2º - uma história sobre o caminho da vida de Paulus von Eicen, um contemporâneo mais jovem de Martin Luther; 3º - correspondência entre o professor Siegfried Byfus, diretor do Instituto de Ateísmo Científico em Berlim Oriental (RDA) e o professor Johanaan Leuchtentrager da Universidade Hebraica de Jerusalém.
Os espíritos imortais Agasfer e Lúcifer, criados por Deus no primeiro dia, são expulsos do céu por se recusarem a se curvar a Adão, que foi criado diante dos olhos do pó e dos quatro elementos. Seus caminhos divergem, para Agasfer, ao contrário de Lúcifer, que anseia pela destruição completa de tudo o que foi criado, espera que o mundo possa ser mudado. A partir de agora, ele está condenado a vagar pela terra até o Juízo Final.
Agasfer tenta convencer o Rebe Yeshua, que acredita que ele é o Filho de Deus, que conquistou o amor e o favor do Pai, que Deus, o Criador do Universo, não é o Deus do amor. Se Yeshua é verdadeiramente o Filho de Deus, então ele deve mudar este mundo, cheio de crueldade e não de justiça. Mas Yeshua se recusa a lutar com Deus e estabelecer seu reino na terra: ele está convencido de que o amor é mais forte que a espada, pronto para se tornar um sacrifício condenado ao massacre e a assumir os pecados do mundo.
Agasfer sabe tudo o que Yeshua espera: a traição de Judá, julgamento, crucificação, morte e ressurreição, após o que ele ascenderá a Deus. Mas isso, como a Agasfer sabe ao certo, não mudará nada no mundo tão sabiamente arranjado. Agasferus conhece Lúcifer, que, brincando com a ganância de Judas Iscariotes, o inspira com a idéia de trair seu professor se ele mesmo quiser que Judas o traia. Agasfer censura Yeshua por passividade e prevê que após sua morte os ensinamentos serão pervertidos e, em nome do amor, praticarão crueldade e injustiça. A última vez que Agasfer convence Yeshua a se tornar o líder e rei de Israel, quando ele leva a cruz ao Calvário e quer descansar nos portões da casa de Agasfer. Agasfer esconde a espada de fogo de Deus debaixo de suas roupas, ele está pronto para criá-lo por causa do sofredor e espalhar seus inimigos, mas ele quer beber completamente o cálice que o Pai lhe deu. Agasfer, enfurecido por sua obstinação, afasta Yeshua, e ele o amaldiçoa, dizendo que a partir de agora ele, Agasfer, terá que esperar pelo retorno do Filho do Homem.
Lúcifer convence Agasfera a ir a Yeshua e perguntar o que ele conseguiu ao assumir os pecados do mundo, pois o mundo não melhorou após o martírio. Agasfer viola a paz celestial do Filho do Homem e o chama a prestar contas, mas ele ainda afirma que a verdade está em Deus, embora Agasfer veja que sua fé na sabedoria e na justiça do Pai está abalada.
Agasfer e Yeshua partiram em busca de Deus. Eles vagam na vastidão do Sheol e encontram um ancião ancião que escreve as letras do Livro da Vida na areia, e o vento as sopra imediatamente. Este velho é Deus. Há muito que ele se decepcionou com sua Criação: ela vive de acordo com suas próprias leis e não há como mudar nada neste mundo terrível, que se tornou irreconhecível até para ele, seu Criador. O Filho do Homem está indignado com o fato de o Pai o ter enviado à cruz, sabendo antecipadamente que isso seria em vão. O Filho do Homem vai à guerra contra fundamentos sagrados, e o Armagedom, a última batalha na terra, começa. Quatro cavaleiros, chamados Fogo, Guerra, Fome e Morte, seguem o Filho do Homem, seguido por hordas de Gogue e Magogue e os anjos do abismo, lançados do céu no sexto dia da Criação, junto com Lúcifer e Agasfera, e diante deles há uma besta com sete cabeças e dez chifres, cujo nome é anticristo.
Lúcifer e Agasfer observam os preparativos para a batalha. As estrelas caem do céu, abrindo as fontes do abismo, toda a terra queima, as pessoas se escondem em cavernas e desfiladeiros das montanhas, mas mesmo ali a morte as ultrapassa. O Filho do Homem, com seu exército, atravessa os céus, subindo mais alto em busca de uma nova Jerusalém, construída de jaspe e ouro puro, mas não é encontrada em nenhum lugar. Quando seu exército começa a murmurar. O Filho do Homem declara que Deus foi derrotado e fugiu e, a partir de agora, Ele, o Filho do Homem, se tornou Deus e criará um novo céu e uma nova terra, um reino de amor e justiça, onde o homem não será um inimigo do homem. Mas todos riem das palavras ingênuas do Filho do Homem: os quatro cavaleiros, Gogi e Magogi, e todas as sete cabeças do Anticristo. O riso infernal de Lúcifer é ouvido, e aparece o mesmo velho que escreveu o Livro da Vida. O Filho do Homem está tentando matá-lo com uma espada, mas o ancião diz que o Filho é a semelhança do Pai e é inseparável Dele. O ancião se torna tão grande que tudo o que pode caber em sua mão direita e pronuncia Seu Nome, o nome secreto de Deus. Aos olhos de Agasfera, que observa esta cena, tudo desaparece: entre o vazio circundante - apenas a figura do Rebe Yeshua, frágil e exausta. Agasfer ouve uma risada distante: isso é tudo o que resta de Lúcifer, o Senhor do abismo e o grande lutador pela ordem. Agasfer e Yeshu "caem no abismo, que é espaço e tempo, e não há nem topo nem fundo, apenas correntes de partículas - ainda não separadas luz e escuridão. Agasfer e o Filho do Homem se fundem em amor e se tornam um, e desde então Deus é um com seu Filho, então Agasfer se torna um com Ele: "um ser, um grande pensamento, um sonho".
O Studiosus Paulus von Eicen, viajando para Wittenberg para estudar com Luther e Melanchthon, conhece um certo Hans Leuchtentrager (o significado do sobrenome alemão Leuchtentrager é idêntico ao significado do nome Lúcifer: carregar luz, portador de luz), que se torna seu companheiro constante e conselhos valiosos. A vida inteira de Eicen. Graças à ajuda de Hans, que conhece todos os segredos da magia e feitiçaria; preguiçoso e míope, mas ambicioso Eicen passa com sucesso nos exames, ganha a confiança e o apoio de Lutero e se torna pastor. Ele faz uma carreira sem pensar sobre por que Hans cuida dela e quais objetivos ele persegue. A figura misteriosa do judeu eterno, ou Agasfera, que invariavelmente deixa o Eicen ganancioso e voluptuoso, um feroz anti-semita, para quem a religião cristã é apenas uma maneira de lidar com seus oponentes e alcançar uma posição sólida na sociedade, repetidamente se põe no caminho da vida de Eitsen.
Eicen organiza uma disputa entre cristãos e judeus e convida o eterno judeu Agasfera a testemunhar que Jesus era o verdadeiro Messias e Filho de Deus. Então, Eicen espera converter os judeus à verdadeira fé e se tornar famoso em toda a Alemanha. Mas Agasfer apenas provoca a estupidez e a hipocrisia religiosa de Eicen, pelas quais ele o submeteu a tortura cruel. Agasfer, espancado por manoplas, morre, e Eitsen espera que ele finalmente se livre do judeu irritante. Muitos anos se passam, mas Agasfer, tão jovem e zombeteiro quanto era no primeiro encontro, aparece novamente diante do velho Eicen. Juntamente com Leuchtentrager, que não mais esconde ser Lúcifer, o Senhor do Submundo, Agasfer, tira a alma de Eicen, tendo lido para ele as palavras do profeta Ezequiel, expondo os pastores do mal.
Um professor da Universidade Hebraica, Johanaan Leuchtentrager, entra em correspondência com Siegfried Weifus e informa que ele conhece pessoalmente Agasfer, contemporâneo do Rebe Yeshua, ou Jesus Cristo. O ateu militante Byfus, que mantém a posição do materialismo dialético, está tentando provar a Leuchtentrager que isso não pode ser, mas no final da correspondência, ele fica tão fascinado pelo mistério de Agasfer que as "autoridades competentes" da RDA, que observam a correspondência dos dois professores, recomendam finalmente Byfus não responda a cartas de Israel: eles estão preocupados que Leuchtentrager esteja indo com seu amigo Agasfer para vir à RDA e assim convencer o Byfus marxista da existência real do judeu eterno. Contudo, ninguém consegue impedir sua chegada à RDA. Em 31 de dezembro de 1981, eles visitaram Byfus no Instituto de Ateísmo Científico, após o qual ele os convidou para sua casa, onde sua família, no círculo de muitos amigos, estava se preparando para a celebração do Ano Novo.
Byfus está trancado com Agasfer e Leuchtentrager em seu escritório e, como sua esposa mais tarde diz a ele, está discutindo com eles há muito tempo. Depois da meia-noite, um grande buraco com bordas carbonizadas é encontrado na parede do escritório de Byfus, mas nem ele nem seus colegas israelenses estão na sala. Durante a investigação, verifica-se que os cidadãos israelenses A. Agasfer e I. Leuchtentrager não receberam vistos e os postos de controle não registraram sua entrada e saída. Mais tarde, sabe-se que, na noite de 31 de dezembro de 1980 a 1º de janeiro de 1981, de serviço da torre de vigia na passagem da fronteira na Friedrichstrasse, três pessoas não identificadas se deslocaram pelo ar. Um rabo de fogo se estendeu por dois e eles carregaram o terceiro sob os braços. Os violadores da fronteira voaram sobre a fronteira da RDA, após o que ganharam altura e desapareceram de vista. Mas as "autoridades competentes" souberam disso muito mais tarde, uma vez que os policiais foram acusados de beber álcool enquanto serviam e cumpriam suas sentenças.