: Uma pessoa com retardo mental tem uma operação para aumentar a inteligência. Ele se torna um gênio, mas o efeito da operação é de curta duração: o herói perde a cabeça e se encontra em um abrigo.
A narração é conduzida na primeira pessoa e é composta por relatórios escritos pelo personagem principal.
O deficiente mental de 32 anos, Charlie Gordon, vive em Nova York e trabalha como zelador em uma padaria particular onde seu tio o levou. Ele mal se lembra de seus pais e irmã mais nova. Charlie vai para uma escola especial, onde a professora Alice Kinnian o ensina a ler e escrever.
Um dia, a senhorita Kinnian o leva ao professor Nemour e ao Dr. Strauss. Eles estão conduzindo um experimento de inteligência e precisam de um voluntário. Miss Kinnian propõe a candidatura de Charlie, o aluno mais capaz de seu grupo. Charlie desde a infância sonha em se tornar inteligente e de bom grado concorda, embora o experimento envolva uma operação arriscada. O psiquiatra e neurocirurgião Strauss pede que ele anote seus pensamentos e sentimentos na forma de relatórios. Os primeiros relatórios de Charlie estão cheios de erros.
Charlie começa a passar nos testes psicológicos padrão, mas ele não obtém sucesso. Charlie tem medo que ela não se encaixe no professor. Gordon conhece o rato Algernon, que já fez cirurgia. A corrida experimental passa pelo labirinto, e Algernon é sempre mais rápido.
Em 7 de março, Charlie está passando por uma cirurgia. Por um tempo nada acontece. Ele continua trabalhando na padaria e não acredita mais que será inteligente. Os trabalhadores da padaria zombam de Charlie, mas ele não entende nada e ri com aqueles que considera amigos. Ele não conta a ninguém sobre a operação e todos os dias ele vai ao laboratório para fazer testes. 29 de março - Charlie passa pela primeira vez o labirinto mais rápido que Algernon. Kinnian começa a lidar com ele individualmente.
Em 1º de abril, os trabalhadores da padaria decidem pregar uma peça em Charlie e forçam-no a ligar a batedeira. De repente, Charlie consegue, e o dono o promove. Gradualmente, Charlie começa a perceber que, para "amigos", ele é apenas um palhaço, sobre quem você pode fazer piadas com impunidade e maldade.
Atingi um novo nível de desenvolvimento. Mas raiva e suspeita foram os primeiros sentimentos que experimentei pelo mundo ao meu redor.
Ele lembra dos casos mais ofensivos, fica endurecido e deixa de confiar nas pessoas. Dr. Strauss realiza sessões de psicoterapia com Charlie. Embora a inteligência de Gordon esteja aumentando, ele sabe muito pouco sobre si mesmo e continua sendo uma criança emocional.
O passado de Charlie, anteriormente escondido dele, começa a esclarecer.
Pareço um homem que dormiu metade da vida e agora está tentando descobrir quem ele era enquanto dormia.
No final de abril, Charlie está mudando tanto que os funcionários da padaria estão começando a tratá-lo com desconfiança e hostilidade. Charlie lembra de sua mãe. Ela não queria admitir que seu filho nasceu com retardo mental, espancou um garoto, forçado a estudar em uma escola regular. O pai de Charlie tentou, sem sucesso, proteger seu filho.
Charlie está apaixonado por sua ex-professora Alice Kinnian. Ela não é tão velha quanto Charlie parecia antes da operação. Alice é mais jovem que ele, e ele começa um namoro inepto. O pensamento de um relacionamento com uma mulher aterroriza Charlie. Isso se deve a uma mãe que temia que seu filho com retardo mental causasse danos à irmã mais nova. Ela levou o garoto a pensar que as mulheres não deveriam ser tocadas. Charlie mudou, mas a proibição que se alojou em sua mente subconsciente ainda está em vigor.
Charlie percebe que o chef sênior da padaria está roubando o proprietário. Charlie o avisa, ameaçando dizer ao proprietário, o roubo para, mas o relacionamento se deteriora completamente. Esta é a primeira decisão importante que Charlie tomou sozinha. Ele aprende a confiar em si mesmo. Charlie empurra Alice para tomar uma decisão.Ele confessa seu amor por ela, mas ela entende que ainda não chegou a hora de um relacionamento assim.
O dono da padaria era amigo de seu tio, prometeu cuidar de Charlie e cumpriu sua promessa. No entanto, agora que Charlie mudou estranhamente, os trabalhadores têm medo dele e ameaçam sair se Charlie permanecer. O proprietário pede que ele saia. Charlie está tentando conversar com ex-amigos, mas eles odeiam o tolo que de repente se tornou mais esperto do que todos eles.
A razão fez uma diferença entre mim e todos que eu conhecia e amei, me levou para fora de casa. Eu nunca me senti tão sozinho.
Charlie não trabalha há duas semanas. Ele tenta escapar da solidão nos braços de Alice, mas nada vem deles. Gordon parece ver a si mesmo e Alice de fora, através dos olhos do ex-Charlie, que está horrorizado e não permite que eles finalmente cheguem perto. Gordon lembra como sua irmã odiava e tinha vergonha dele.
Charlie está ficando mais esperto. Logo, outros deixam de entendê-lo. Por causa disso, ele briga com Alice - ela se sente ao lado dele um completo tolo. Charlie se afasta de todos que ele conhecia e mergulha na escola.
Em 10 de junho, o professor Nemour e o Dr. Strauss voam para o simpósio médico em Chicago. As principais "exposições" deste grande evento serão Charlie e Mouse Algernon. No avião, Charlie se lembra de como sua mãe tentou sem sucesso curá-lo, para torná-lo mais inteligente. Ela gastou quase todas as economias da família nas quais seu pai, um vendedor de equipamentos de cabeleireiro, queria abrir seu próprio cabeleireiro. A mãe deixou Charlie sozinho, tendo dado à luz novamente e provando que é capaz de ter filhos saudáveis. Charlie sonhava em se tornar uma pessoa normal, para que sua mãe finalmente se apaixonasse por ele.
Todos os dias aprendo algo novo sobre mim, e as memórias que começaram com uma pequena onda me varrem sobre uma tempestade de dez pontos.
No simpósio, Charlie descobre um conhecimento tão vasto e alta inteligência que professores e acadêmicos empalidecem diante de seu passado. Isso não impede o professor Nemur de chamá-lo de "sua criação" equiparando Charlie ao rato Algernon. O professor tem certeza de que antes da operação, Charlie era uma "concha vazia" e não existia como pessoa. Muitos consideram Charlie arrogante e intolerante, mas ele simplesmente não consegue encontrar seu lugar na vida. Em um relatório sobre cirurgia para melhorar a inteligência, Gordon se sente como um animal experimental. Em protesto, ele libera Algernon da gaiola, depois o encontra e voa para casa.
Em Nova York, Gordon vê um jornal com uma fotografia de sua mãe e irmã. Ele lembra como sua mãe forçou seu pai a levá-lo para um abrigo. Após o nascimento de uma filha saudável, o filho com retardo mental despertou com seu único desgosto.
Charlie aluga um apartamento mobiliado com quatro quartos perto da biblioteca. Em uma das salas, ele organiza um labirinto tridimensional para Algernon. Charlie nem relata seu paradeiro para Alice Kinnigan. Logo ele conheceu um vizinho - um artista livre. Para se livrar da solidão e garantir sua capacidade de estar com uma mulher, Charlie entra em um relacionamento com um vizinho. O ex-Charlie não interfere no relacionamento, já que essa mulher é indiferente a ele, ele apenas observa o que está acontecendo de lado.
Charlie encontra um pai que se divorciou de sua esposa e abriu um cabeleireiro em um bairro pobre. Ele não reconhece o filho e não se atreve a abrir. Gordon descobre que depois de beber muito, ele se transforma em um Charlie com retardo mental. O álcool libera seu subconsciente, que ainda não alcançou o QI que cresce rapidamente.
Nada em nós desaparece sem deixar rasto. A operação cobriu Charlie com uma fina camada de cultura e educação, mas ele permaneceu. Ele olha e espera.
Agora Charlie está tentando não ficar bêbado. Ele caminha por um longo tempo, entra em um café. Um dia, ele vê um garçom, um cara com retardo mental, solta uma bandeja de pratos e os visitantes começam a tirar sarro dele.
É incrível como pessoas de altos princípios morais ...nunca se permitindo tirar vantagem de um homem nascido sem braços, pernas ou olhos ... zomba fácil e impensadamente de um homem nascido sem razão.
Isso encoraja Gordon a continuar seu trabalho científico para beneficiar essas pessoas. Tendo tomado uma decisão, ele se encontra com Alice. Ele explica que a ama, mas entre eles está um garotinho Charlie, que tem medo de mulheres porque sua mãe o venceu.
Charlie começa a trabalhar no laboratório. Ele não tem tempo para uma amante e ela o deixa. Algernon começa estranhos ataques de agressão. Às vezes, ele não pode passar por seu labirinto. Charlie leva o mouse para o laboratório. Ele pergunta ao professor Nemour o que eles fariam com ele em caso de falha. Acontece que Charlie recebeu um lugar na escola social e hospital estadual "Warren". Gordon visita este lugar para saber o que o espera.
Algernon está piorando, ele se recusa a comer. Charlie atinge o pico da atividade mental.
Como se todo o conhecimento que adquiri nos últimos meses tivesse se unido e me levado ao auge da luz e do entendimento.
Em 26 de agosto, Gordon encontra um erro nos cálculos do professor Nemour. Charlie percebe que em breve começará uma regressão mental, a mesma de Algernon. 15 de setembro Algernon morre. Charlie o enterra no quintal. 22 de setembro: Gordon visita sua mãe e irmã. Ele descobre que sua mãe tem senilidade. Irmã é difícil com ela, ela está feliz que Charlie os encontrou. A irmã não suspeitava que sua mãe se livrou de Charlie por ela. Gordon promete ajudá-los o máximo que puder.
O QI de Gordon está diminuindo rapidamente, ele está se esquecendo. Livros, antes amados, agora são incompreensíveis para ele. Alice vem para Gordon. Desta vez, o ex-Charlie não impede seu amor. Ela fica por várias semanas, cuidando de Charlie. Logo, ele bane Alice - ela o lembra de habilidades que não podem ser devolvidas. Nos relatórios que Charlie ainda escreve, há mais e mais erros. No final, eles se tornam os mesmos de antes da operação.
20 de novembro, Charlie retorna à padaria. Os trabalhadores que costumavam zombar dele agora o apadrinham e protegem. No entanto, Charlie ainda se lembra de ser inteligente. Ele não quer ser poupado e vai para Warren. Ele escreve uma carta de despedida para Miss Kinnian, na qual pede para colocar flores no túmulo de Algernon.